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本校自民國39年至今，已累積46餘萬件的檔案，均列為本校重要資產之一，而今「檔案」隨著時代的脈動，其管理方式不再只是靜態的資料整理，而是已從傳統的文字資料記載，轉換成智慧結晶的互動性資訊，且具有活潑多元、關懷人群、重視社會意識的檔案價值開發。為迎合時代趨勢，民國90年檔案管理局正式成立後，陸續頒訂各項檔案管理法規，促使檔管人員針對妥善保管、典藏及推展檔案知識與價值有所依循，是邁出檔案管理一大步。檔案是歷史的紀錄，惟有妥善保存歷史資料才是對歷史負責最具體的表徵，因此，本校期許透過檔案管理的標準化、專業化與制度化，使本校檔案管理步上正軌。
（一）檔案典藏數量
本校檔案庫房控管有紙本檔案約42餘萬件、光碟片60餘片。近4年來國防部推動「減紙減量」，本校發文量皆有持續減少（本校將持續宣導網頁電子公告機制）。
（二）專業化、制度化及多元化管理：
本校檔管人員透過多元學習管道，積極參與各項檔案管理理論與實務訓練，提升專業知能，推動各項檔管業務。制定本校檔案管理辦法及各項檔管標準作業流程。有關歸檔案件點收、立案、編目、保管、檢調、清理、稽催、機密檔案管理及安全維護等相關作業，目前本校系統與國防部同步使用「全程電子化公文檔案管理系統V2.0版」，本系統（經過中華民國資訊軟體協會驗證合格之軟體，並附驗證合格證書）。
（三）專案執行回溯檔案目錄建置、彙送：
自民國94年起，本校已現有檔案管理人員輪流執行檔案整理，由94年開始檔案目錄彙送作業，並於99年執行回朔檔案建檔，目前已將39至105年檔案目錄彙送至檔案管理局。
（四）推廣檔案應用服務：
以服務為目的，設置無障礙坡道、民眾檔案應用專區提供多元化檔案應用服務，期許增加檔案開放應用價值。
（五）辦理檔案文物展覽：
為加深民眾對本校檔案的嘹解，於99年11月22日至99年11月28日本校軍史館辦理文物檔案展覽，以：「回顧空軍軍史，延續筧橋精神」為主題。另總計來訪軍方單位8隊、民間團體31團、海外國家1團，參訪人數計2,300員，充分展現檔案的珍貴與價值。
（六）檔案庫房安全管理：
本校於校本部第三棟檔案室一樓設置檔案民眾閱覽區，並於99年汰換老舊檔案櫃、改善空調設備、C02消防設備、ㄧ樓建置不銹鋼防水閘欄及永久檔案庫房建置氬氣消防環控系統（空軍檔案庫房唯一優先建置），三組檔案庫房監視系統及採用低紫外線照明等設備等等，以符合「檔案管理局檔案庫房設施基準」規定。